Movable Type 4シリーズで、ユーザー登録時に確認のため届くメールのタイトル
「Movable Type アカウント登録確認」
を修正するには、
lib/MT/L10N/ja.pm
ファイルを修正します。

「Movable Type アカウント登録確認」はだいたい2008行目にあります。